Travaux

Devoir 1 questions 1-4.1 : à remettre le 6 février, à 17:30; question 4.2 (implantation de l'algorithme) : à remettre le 9 février à 17:30.
Énoncé (23 janvier) : PDF
Solutions : [désactivé]
Devoir 2 à remettre le 8 mars à 17:30.
Énoncé (20 février) : PDF
Références
  • Robert J. Klein, Ziva Misulovin, and et R. Eddy. Noncoding RNA genes identified in AT-rich hyperthermophiles. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, 99: 7542-7547 (2002). Le TP est basé sur cet article. > HTML
  • Peter Schattner. Searching for RNA genes using base-composition statistics. Nucleic Acids Research, 30: 2076-2082 (2002). Un autre article qui utilise la même idée de base mais sans HMM. > HTML
  • Page du génome de M. jannaschii à NCBI.
Devoir 3 à remettre le 29 mars à 17:30.
Énoncé (19 mars) : PDF