Travaux
- Devoir 1 questions 1-4.1 : à remettre le 6 février, à 17:30;
question 4.2 (implantation de l'algorithme) : à remettre le 9 février à 17:30.
- Énoncé (23 janvier) : PDF
- Solutions : [désactivé]
- Devoir 2
à remettre le 8 mars à 17:30.
- Énoncé (20 février) : PDF
- Références
- Robert J. Klein, Ziva Misulovin, and et R. Eddy.
Noncoding RNA genes identified in AT-rich hyperthermophiles.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA,
99: 7542-7547 (2002).
Le TP est basé sur cet article.
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HTML
- Peter Schattner.
Searching for RNA genes using base-composition statistics.
Nucleic Acids Research,
30: 2076-2082 (2002).
Un autre article qui utilise la même idée de base mais sans HMM.
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HTML
- Page du
génome de M. jannaschii
à NCBI.
- Devoir 3
à remettre le 29 mars à 17:30.
- Énoncé (19 mars) : PDF