Plan de cours

Professeur: Miklós Csürös
Bureau: AA 3253
Tél: 343-6111 poste 1655
Courriel: mon courriel

Horaire

Activité Jour Heure Local
thmercredi11:30-13:30Z 215
thvendredi14:30-16:30Z 350
intramercredi 22 février11:30-13:30Z 215
finalmercredi 19 avril12:30-15:30Z 350

Préalables

IFT2010 Programmation 2 et MAT1978 Probabilités et statistique. Aucune connaissance en biologie n'est nécessaire : de la curiosité et un peu de culture générale suffisent.

Contenu général et objectifs du cours

Ce cours sert comme introduction à la discipline de bioinformatique. L'approche principale est algorithmique : on examinera des principes algorithmiques applicables à l'étude d'organismes vivants au niveau moléculaire, ainsi que l'implantation d'algorithmes à l'aide de macromolécules.

Liste de sujets abordés:

Bibliographie

Il n'y a pas de livre principal. Les notes de cours seront affichées sur le site du cours: http://www.iro.umontreal.ca/~csuros/IFT3290/.

Livres de référence

Neil C. Jones & Pavel A. Pevzner. An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, 2004.
Très bonne introduction aux méthodes algorithmiques en bioinformatique avec très peu de prérequis en informatique. Recommandé pour ceux qui n'ont pas pris IFT2121.
Warren J. Ewens & Gregory R. Grant. Statistical Methods in Bioinformatics. Springer-Verlag, 2001. (2ème édition en 2005.)
Texte surtout sur les aspects statistiques de la bioinformatique. Très utile pour la modélisation sensible de problèmes, ce qui est essentielle pour la conception d'algorithmes efficaces.

Évaluation

Présentation: 10% TPs: 30% intra: 30% final: 30%

Chaque étudiante ou étudiant doit donner une présentation d'à peu près 20 minutes à la classe sur un sujet choisi. Il y aura 4 travaux pratiques, incluant des devoirs de nature théorique et des travaux de programmation.