Nadia El-Mabrouk

Département d'informatique et de recherche opérationnelle (DIRO)

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Contact

Nadia El-Mabrouk
Département d'informatique et de recherche opérationnelle
Université de Montréal
Pavillon André-Aisenstadt
CP 6128 succ Centre-Ville
Montréal, Québec H3C 3J7

Canada

Bureau: 3163 Pav. André Aisenstadt
Tel.: 514-343-7481


Conférence MAGE: Modèles et Algorithmes pour la Gènomique Evolutive.
En l'honneur des 50 ans de recherche scientifique de David Sankoff
Du 23 au 26 août 2013 à l'hôtel Château Bromont

Nadia El-Mabrouk est professeure titulaire au département d'informatique de l'université de Montréal. Elle detient un Ph.D. en Informatique théorique de l'universite Paris VII, obtenu en 1996. Elle est membre du Centre de Recherche Mathematiques et du Centre Robert Cedergren . Son domaine de recherche est la biologie computationnelle. Ses projets de recherche principaux sont reliés au developpement de méthodes algorithmiques et mathematiques pour la génomique comparative. Elle œuvre regulièrement dans les comité de programme des conférences de Bio-informatiques telles que RECOMB, RECOMB-CG, ISMB, ECCB et WABI.






Logiciels

OrthoAlign .zip directory
A software for the gene order alignment problem (alignment of orthologs), accounting for most genome-wide evolutionary events such as duplications, losses, rearrangements and substitutions. Described in ``Evolution of tRNA Repertoires in Bacillus with OrthoAlign'', by O. Tremblay-Savard, B. Benzaid, F.B. Lang and N. El-Mabrouk, submitted to Molecular Biology and Evolution.

GapAdj .tar.gz directory
Logiciel décrit dans: A Flexible Ancestral Genome Reconstruction Method based on Gapped Adjacencies Y. Gagnon, M. Blanchette and N. El-Mabrouk, RECOMB-CG, 2012.

DILTAG
Interface WEB du logiciel décrit dans: Inferring the Evolutionary History of Gene Clusters from Phylogenetic and Gene Order Data. M. Lajoie, D. Bertrand and N. El-Mabrouk., Molecular Biology and Evolution, doi: 10.1093/molbev/msp271, 2009.