-IFT3295/IFT6291-AUTOMNE-2011

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CENTRE DE MESSAGES:

Horaire:

  • Mardi 13:30-15:30, Local 1409 Pavillon AA

  • Mercredi 9:30-11:30, Local 1409 Pavillon AA
  • INTRA:
  • Mardi 18 Octobre 13:30-15:30, Local 11175 Pavillon AA

  • Aucune documentation permise
  • IFT3295 - Bio-informatique

    Automne 2011


    Présentation générale.



    Professeur: Nadia El-Mabrouk
    Démonstrateurs: Oliver Tremblay-Savard et Yves Gagnon
    Courriel: mabrouk AT iro.umontreal.ca
    Courriels: olivier.tremblay.savard AT gmail.com , y.gagnon AT umontreal.ca
    Local: 3163
    Locaux: 3165 , 3174




    Qu'est ce que la Bio-informatique?

    La bio-informatique est une spécialisation de l'informatique dédiée au traitement rationnel de l'information biologique. Elle s'est développée depuis le début des années 90 et parallèlement au projet du génome humain. La bio-informatique est un champ d'étude pluridisciplinaire où travaillent de concert biologistes et informaticiens sur la modélisation des phénomènes du vivant.

    Ce cours ...

    ... est consacré à la bio-informatique. Il intéressera l'informaticien désireux d'en savoir plus sur cette discipline, qu'il soit simple curieux ou celui qui désire étudier ses questions fondamentales et les structures algorithmes et logiciels qu'on utilise pour y répondre.

    Il s'agit d'une introduction à l'algorithmique de la discipline et ainsi, aucune notion de biologie n'est pré-requise.

    L'étudiant qui désire en savoir plus après avoir suivi ce cours pourra poursuivre à travers les cours offerts aux grades supérieurs, tels que IFT6290, IFT6291 et IFT629.

    Quelques livres de référence

    • "Handbook of Computational Molecular Biology", S. Aluru, Chapman & Hall/CRC, 2006.
    • "Bioinformatics algorithms - Techniques and applications", I.I. Mandoiu and A. Zelikovsky, Wiley Series on Bioinformatics, 2008.
    • "Algorithms on Strings, Trees and Sequences - Computer Science and Computational Biology", Dan Gusfield, Cambridge University Press, 1997.
    • " Biological sequence analysis - Probabilistic models of proteins and nucleic acids", R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh and G. Mitchison, 1998.
    • "Introduction to Computational Molecular Biology", J. Setubal and J. Meidanis, PWS Publishing Company, 1997.
    • "Combinatorics of Genome Rearrangements", G. Fertin, A. Labarre, I. Rusu, E. Tannier and S. Vialette, The MIT Press, 2009.

    Quelques journaux de référence

    Quelques liens utiles

    A venir...