Page TP IFT3295
Démonstrateur : Anna Thibert
Email : anna.thibert(AT)umontreal.ca
Local : AA-3174 (laboratoire du LBIT)
Disponibilités : Jeudi 15h à 17h (ou prendre rendez-vous par email)
Pas de dispo le jeudi 14 novembre
Email : anna.thibert(AT)umontreal.ca
Local : AA-3174 (laboratoire du LBIT)
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notes ift3295
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TP
TP1 à rendre pour le 2 octobre Extension pour le 6 octobre
TP2 à rendre avant le 30 octobre
Fichiers : sequences.fasta, matrice Blosum
TP3 à rendre avant le jeudi 21 novembre (mercredi 20 novembre 23h59 dernier délai)
Fichiers : tRNAs.fasta, unknown.fasta
TP4 à rendre le mercredi 4 décembre avant la démo
Démos
Démo 1 [Mercredi 11 Septembre]
insulin.fasta- Pondération des gaps
- Programmation dynamique pour l'alignement
- Séquences biologiques et banques de données
Démo 2 [Mercredi 18 Septembre]
Présentation ppt- Présentation du TP1 à rendre pour le 2 octobre
- Programmation dynamique pour l'alignement
- Optimisation, algorithme d'Hirshberg
Démo 3 [Mercredi 25 Septembre]
Présentation ppt- Structures secondaires d'ARN
- Alignement multiple exact
Démo 4 [Mercredi 2 octobre]
- Alignement multiple de séquences
Démo 5 [Mercredi 9 Octobre]
- Préparation du l'intra du 15 octobre
[Semaine de relâche]
Pas de cours ni de démo le 22 et le 23 octobre
Démo 6 [Mercredi 30 Octobre]
- Correction intra
- Présentation du TP3
Démo 7 [Mercredi 6 Novembre]
- Arbres des suffixes
Démo 8 [Mardi 12 Novembre - sur le créneau du cours]
- Phylogénie
- Aide pour le calcul de dn/ds
Démo 9 [Mardi 19 Novembre - sur le créneau du cours]
- Présentation du TP4
- Phylogénie - méthodes de distance
Démo 10 [Mercredi 10 Décembre]
- Révisions (correction d'un examen des années précédentes)