Page TP IFT3295

Démonstrateur : Robin Milosz
Email : miloszro(AT)iro.umontreal.ca
Local : AA-3174 (laboratoire du LBIT)
Disponibilités : Lundi de 14h30 à 16h30 et mardi de 16h00 à 17h00 (ou prendre rendez-vous par email)

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Page du cours IFT3295


Démo 1 [Mardi 11 Septembre]

La démo portera sur la programmation dynamique, les séquences biologiques et les banques données.
démo 1
insulin.fasta

Démo 2 [Mardi 18 Septembre]

La démo portera sur la présentation du TP1 et sur la programmation dynamique.
démo 2

TP1

(à rendre le 2 octobre, *extension jusqu'au 9 octobre)
TP1
reads.fq
sequence.fasta
geneX.fasta

Démo 3 [Mardi 25 Septembre]

La démo portera sur les structures secondaires d'ARN et sur l'alignement multiple exact.
démo 3

Démo 4 [Mardi 9 Octobre]

La démo portera sur l'alignement multiple, la correction du TP1 et la présentation du TP2.
démo 4

TP2

(à rendre le 29 octobre)
TP2
BLOSUM62.txt
sequences.fasta

Démo 5 [Mardi 16 Octobre]

La démo portera sur la recherche exacte de motif: prétraitement, Knuth-Morris-Pratt et Aho-Corasick.

[Semaine de relâche]

Démo 6 [Lundi 29 Octobre]

La démo (2h) portera sur la préparation pour l'examen intra (qui sera mardi, pas de démo). On fera l'intra de 2017.

Démo 7 [Mardi 6 Novembre]

La démo portera sur la correction de l'intra et sur la présentation du TP3.

TP3

(à rendre le 20 Novembre)
TP3
tRNAs.fasta
unknown.fasta

Démo 8 [Mardi 13 Novembre]

La démo portera sur les arbres suffixes.
démo 8

Démo 9 [Mardi 20 Novembre]

La démo portera sur la phylogénétique et sur la présentation du TP4.
démo 9

TP4

(à rendre le 4 Décembre)
TP4
donneesTP4.zip (données biologiques et textes)
donneesTP4.tar.gz

Démo 10 [Mardi 27 Novembre]

La démo portera sur la phylogénétique.
démo 10

Démo 11 [Mardi 4 Décembre]

La démo portera sur la révision. On fera un examen final antérieur.